A teoria endossimbiótica, com suporte nas relações mutualísticas. Propõem que:os primeiros seres eucariontes eram organismos anaeróbios heterotróficos que se alimentavam de outras bactérias. Quando algumas bactérias primitivas passaram a converter substâncias inorgânicas em orgânicas, evoluindo para a capacidade fotossintetizante , tornando-se células autotróficas e, outras tornaram-se células heterotróficas com capacidade aeróbia(de viver no ar).
As bactérias aeróbias e as bactérias fotossintéticas teriam mantido relações simbióticas harmoniosas . As bactérias recebiam proteção e nutrientes, enquanto os eucariotos de estrutura celular rudimentar passavam então a aproveitar o processo aeróbico e fotossintético realizado por essas bactérias. Convivendo assim de forma com benefício para ambas as partes,surgiram as mitocôndrias e os cloroplastos no interior das células eucariotas atuais.
'A teoria endossimbiótica foi criada pela bióloga americana Lynn Margulis(1981) e baseia-se em várias evidências:
• Tanto as mitocôndrias como os cloroplastos possuem DNA próprio e bastante diferente do que existe no núcleo celular;
• As mitocôndrias utilizam um código genético diferente do da célula eucariótica hospedeira e semelhante as de diferentes espécies;
• Ambos estas organelas se encontram rodeados por duas ou mais membranas e a mais interna tem diferenças na composição em relação às outras membranas da célula e semelhanças com a dos procariontes;
• Ambas se formam por divisão binária, como é comum nas bactérias.
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